新一期的《自然》杂志增刊对 2017 年自然指数排行榜 (Nature Index 2017 Tables) 进行了更新。与之前更新不同的是，本次的自然指数 (Nature Index, NI) 加入了 Innovation 板块，专门引入了来自开放数据平台 Lens.org 的数据“Lens 分数 (Lens score)”。
Nature Index 排名 (2016.4.1-2017.3.31)
近几年来，随着中国基础科研水平的不断提高，中国在 Nature Index 上的影响力逐渐升高。
Nature 公布了 2016 年 4 月 1 日至 2017 年 3 月 31 日的 Nature Index。统计表明，在一年时间内，中国科研人员共在 68 份被 NI 收录的顶级期刊上发表了 9462 篇文章，仅次于美国，位列世界第二。其中，物理科学 3653 篇，化学 4886 篇，生命科学 1456 篇，地球与环境科学 499 篇。贡献多的分别为中国科学院 (3407 篇)，北京大学 (1070 篇) 以及清华大学 (821 篇)。同时，中国也是世界第 4 大合作国，与大多数国家存在着良好的合作关系。
(2016 年，中国和其他国家和地区间的科研合作图 )
在包括了大学、政府研究机构、企业、医院以及非政府组织等的综合排名中，中国科学院以 WFC 1176.71 (WFC 为经过作者贡献比例和学科分布调整后的论文发表数量) 的成绩位居榜首，美国哈佛大学排名第二、德国马克斯·普朗克学会排名第三。之后则是法国国家科学研究中心、美国斯坦福大学、美国麻省理工大学、英国牛津大学等。
综合排名：世界 Top 10
在全球大学的排名中，美国的哈佛大学、斯坦福大学、麻省理工大学、英国的牛津大学、剑桥大学分别位列排行榜的第 1 至第 5。北京大学排在第 9 位，比去年上升 2 位。中国高校跻身世界排名前 50 的还有清华大学 (12)、南京大学 (13)、中国科学技术大学 (19)、浙江大学 (37)、复旦大学 (45) 和中国科学院大学 (50)。
大学排名：世界 Top 20
大学排名：世界 Top 100 的中国大学
在医疗系统排名中，美国德克萨斯大学西南医学中心 (UT Southwestern Medical Center)、约翰霍普金斯医学中心 (JHMI) 和哥伦比亚大学医学中心 (CUMC) 分别以 103.4、102.6 和 80.38 的成绩分别排名世界前 3。四川大学华西医院、中山大学附属肿瘤医院以及上海长征医院分别位列中国前 3。
医疗机构排名：世界 Top 5
医疗机构排名：中国 Top 10
Nature Index 是什么？
Nature Index 汇集了包括 Nature、Science、Cell 等 68 份科研期刊的论文，反映了机构、国家及地区的基础科学研究水平。排行榜以文章发表数量为主要指标，并对于作者贡献比例、不同学科分布进行了加权，得到 WFC(Weighted fractional count) 值进行排名。
然而，与其他排行榜不同的是，该排名仅仅包括了物理、化学、生命科学及地球与环境科学的相关研究结果，而对于数学、计算机科学、工程科学、临床研究等几乎没有涉及。因此，只反映了机构的自然科学成果及影响力，而不能够体现完整的科研实力，也不能反映研究成果转化的情况。
Lens 分数排名
Lens 分数主要反映了已发表的学术文章在专利申请中的引用情况。如果 Lens 分数较高，则意味着该科研机构或高校的研究有更高比例被专利文件引用；换句话说，这些研究成果更有可能启发了创新，呈现出良好的学术转化趋势。
根据 Lens 分数，在新的全球排名中，共有 12 所中国内地高校及科研机构进入世界前 200 名。其中，苏州大学的 Lens 分数达到 2.31，排在中国内地首位。尽管从传统的三个 Nature Index 来看，苏州大学的学术论文发表数量少于北大、复旦等高校，但是在科研转化方面有更强的影响力 (特别是在材料化学领域)。
中国高校 / 科研机构的 Lens 分数排名
中国高校 / 科研机构的 WFC 排名
值得一提的是，与 WFC 排名相比，使用 Lens 分数排名时，中国科研机构和高校的排名位次较靠后，均排在 150 名之后。科研转化和创新 Lens 创始人 Richard Jefferson 指出，“For innovation to bring public benefit, mapping the influence of academic papers is just the beginning”。这是因为专利申请往往是科研转化中的重要一步。因此，Lens.org 通过从专利申请当中提取了参考文献，再和科研机构的研究成果比对，以观察学术研究成果和科研转化之间的相关性。
关于这个相关性，一个很好的例子就是生化学家 Michael Sporn。在他 1959 至 2006 年发表的学术论文中，超过一半被专利文书引用，启发了无数的针对癌症、纤维化以及其他病症的临床药物研究。再举一个例子，生物信息学家 David Lipman 和他的研究团队构建了一个公开的数据库，让其他的研究者可以在其中进行 DNA 序列检索和匹配 (BLAST)。根据 Lens 数据库，这篇文章被将近 5 千份同族专利 (patent family) 文书引用。
相比于在基础科研得出结果，将成果转化并推动社会发展是一条漫漫征途。例如，对于一个虽然被证实有效，但是利润空间非常有限的疫苗，可能很难找到制药公司对它进行临床研发。也就是说，想要使用疫苗来对抗疾病，仅仅有基础研究证明它的有效性是远远不够的，我们还需要很多其他不可或缺的步骤，如通过临床研究证明它的安全性和临床有效性，通过监管机构的审批，进行市场推广等等。
将学术论文和专利申请联系在一起，可以让这个转化链条中的各方更好地认识这个转化和创新的过程，而 Lens 分数就是我们迈出的第一步。
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